Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms