Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms