Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ARXQ96QS3 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms