Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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BEST4Q8NFU0 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BEST4Q8NFU0 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
BEST4Q8NFU0 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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