Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms