Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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