Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
IMPG1Q17R60 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IMPG1Q17R60 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms