Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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