Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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