Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCN9AQ15858 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SCN9AQ15858 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
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