Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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