Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms