Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDK13Q14004 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDK13Q14004 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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