Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms