Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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