Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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