Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms