Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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