Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PICALMQ13492 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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