Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms