Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms