Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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