Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SCGB2A2Q13296 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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