Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR1H3Q13133 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR1H3Q13133 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR1H3Q13133 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR1H3Q13133 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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