Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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