Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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