Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms