Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2AQ12879 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GRIN2AQ12879 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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