Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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