Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VGFO15240 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
VGFO15240 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VGFO15240 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
VGFO15240 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
VGFO15240 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms