Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SHOC2Q9UQ13 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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