Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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