Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
SMG1Q96Q15 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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