Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MIRLET7I-201ENST00000362309 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 LINC00159-201ENST00000411605 438 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL157395.1-201ENST00000427630 438 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC079355.2-201ENST00000440057 190 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 PCED1B-AS1-206ENST00000550426 683 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 PCED1B-AS1-211ENST00000552990 654 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MIR4419A-201ENST00000583845 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AL022345.3-201ENST00000611406 228 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 TRBV27-201ENST00000390399 387 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRAC1Q96KF2 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms