Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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