Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CCDC142Q17RM4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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