Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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