Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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