Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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