Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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