Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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