Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SF3A1Q15459 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3A1Q15459 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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