Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms