Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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