Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms