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| BRD3 | Q15059 | AC080014.1-201 | ENST00000496877 | 1201 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL139147.1-201 | ENST00000502413 | 1156 nt | TSL 2 BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC026784.1-201 | ENST00000507986 | 352 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL161457.2-203 | ENST00000590767 | 2663 nt | TSL 5 BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | CYSLTR2-201 | ENST00000282018 | 4672 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | THEMIS-202 | ENST00000368250 | 4101 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGB1-201 | ENST00000326004 | 821 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPPA3-201 | ENST00000345088 | 1079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR6C69P-201 | ENST00000394268 | 893 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AP001136.1-201 | ENST00000425058 | 635 nt | TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC01757-201 | ENST00000435552 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL139289.1-201 | ENST00000436713 | 731 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006011.1-201 | ENST00000442758 | 349 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTATP6P30-201 | ENST00000443540 | 664 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC020550.1-201 | ENST00000447385 | 163 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | UQCRHP4-201 | ENST00000471686 | 272 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | ANKRD7-204 | ENST00000477532 | 744 nt | TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL32P34-201 | ENST00000486380 | 400 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRBV12-2-201 | ENST00000489763 | 344 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LYRM7-202 | ENST00000507584 | 317 nt | TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.695-201 | ENST00000516715 | 107 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC107909.2-201 | ENST00000520844 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068992.1-201 | ENST00000521411 | 543 nt | TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | CYCSP29-201 | ENST00000533731 | 318 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL358335.2-201 | ENST00000555693 | 487 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087463.4-202 | ENST00000566676 | 579 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC144836.1-201 | ENST00000575911 | 340 nt | TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022655.2-201 | ENST00000577280 | 318 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4738-201 | ENST00000579134 | 87 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4425-201 | ENST00000580572 | 84 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC002545.1-201 | ENST00000592511 | 181 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000860.1-201 | ENST00000605250 | 559 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR6830-201 | ENST00000636015 | 70 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHM-205 | ENST00000615443 | 2821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | CRISP3-204 | ENST00000433368 | 2205 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | DAZ4-202 | ENST00000382314 | 3910 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | PGGT1B-203 | ENST00000419445 | 9545 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | CAPS2-206 | ENST00000409799 | 1859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007785.2-201 | ENST00000598627 | 1916 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRG4-203 | ENST00000394143 | 9931 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR1S2-201 | ENST00000302592 | 978 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00862-202 | ENST00000367356 | 759 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRIM2-202 | ENST00000370687 | 909 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1077P-201 | ENST00000410506 | 102 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z85995.1-201 | ENST00000415547 | 335 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092155.1-202 | ENST00000416111 | 932 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS15AP12-201 | ENST00000419498 | 388 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL17P36-201 | ENST00000420302 | 549 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006366.1-201 | ENST00000422002 | 759 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRIM60P10Y-201 | ENST00000425589 | 751 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC020571.1-201 | ENST00000430904 | 768 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRIM60P8Y-201 | ENST00000436338 | 762 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005871.1-201 | ENST00000450247 | 475 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL445465.2-201 | ENST00000455530 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01510-203 | ENST00000458082 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP14-201 | ENST00000468281 | 468 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010618.1-201 | ENST00000469924 | 477 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | VN1R105P-201 | ENST00000486595 | 910 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091167.1-201 | ENST00000492017 | 396 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006445.2-201 | ENST00000510061 | 472 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP209-201 | ENST00000516888 | 304 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073655.2-202 | ENST00000547927 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079203.2-201 | ENST00000559867 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL161729.3-201 | ENST00000603533 | 673 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | STARD13-AS-239 | ENST00000609588 | 982 nt | TSL 5 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC108479.2-201 | ENST00000617314 | 601 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006338.1-201 | ENST00000618453 | 749 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC110801.1-201 | ENST00000623590 | 212 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3653-201 | ENST00000625572 | 110 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR52H1-202 | ENST00000641796 | 1061 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR2M2-203 | ENST00000641836 | 1151 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |