Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RAB3GAP1Q15042 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB3GAP1Q15042 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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