Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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