Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms