Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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