Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GTF2H3Q13889 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GTF2H3Q13889 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms